Quando o arquipélago foi descoberto, as ilhas eram desertas,  foram baptizadas de acordo com o calendário litúrgico da época, ficando com o nome do santo do dia da sua descoberta.

No testamento do Infante D. Henrique, de 1460, estão como foram baptizadas : Santa Maria, S. Miguel, Ilha de Jesus Cristo, Graciosa, S. Luís, S. Dinis, S. Jorge, Santa Iria e S. Tomás.

Alguns historiadores dizem-nos que Santa Maria e S. Miguel devem os seus nomes, respectivamente, à devoção do Infante D. Henrique e do Infante D. Pedro por esses santos. 

Algumas ilhas mantiveram os nomes originais. Outras mudaram de nome através dos tempos:

 A ilha de Jesus Cristo passa a Terceira ,por ter sido a terceira a ser encontrada

 lha de S. Dinis passa a Faial,

 A ilha de S. Luís fica conhecida por Pico, devido as suas muitas rochas vulcânicas  

Santa Iria passa ser  as Flores 

S. Tomás passa a Corvo.

As ilhas tb são representadas por cores, cada ilha tem a sua, que a identifica tal como o seu nome, cores estas atribuídas de acordo com a característica mais marcante que possua. Assim: